学校现有在职教工905人，其中专任教师598人，教授、副教授193人，有硕士以上学位教师480人，聘有兼职教授446人。教师队伍中，有“全国劳动模范”、“全国五一劳动奖章”、“全国优秀教师”、“国家级教学名师”、“山东省百名英模人物”、中青年突出贡献专家、国务院政府特殊津贴、泰山学者海外特聘专家等50余名。

济宁医学院前身是创建于1952年的山东省济宁医士学校，1958年改为济宁医学院，招收第一届本科生；1959年改为济宁医学专科学校； 1987年1月，经原国家教育委员会批准，更名为济宁医学院；2008年4月学校以“优秀”成绩顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估。

近三届毕业生年底就业率平均为88.89%。

学校面向全国25个省、市招生，现有全日制本专科在校生16000余人。有计划招收部分美国、日本、尼泊尔、巴基斯坦等国家或地区留学生。

新生全部入住日照校区，住宿费每人每学年1000元。每房间安排5～6人，为每人配备学习桌、书架、衣柜，每房间均有电话、网络接口、卫生间，集中供暖。

病理学与病理生理学、神经病学、心血管疾病研究诊疗中心、神经内科学为山东省重点学科；学校现有行为医学、心血管疾病诊治、职业卫生与环境医学等省级重点实验室。有山东省行为医学研究所、心血管诊疗中心、神经生物学研究所等28个研究机构。